肛周脓肿手术后可能出现的后遗症包括形成肛瘘、排便异常、直肠黏膜脱垂等。应选择正规医院进行手术，术后做好伤口护理，培养良好饮食习惯与排便习惯，可起到一定预防作用。
一、形成肛瘘：肛周脓肿术后若护理不当或手术清除不彻底，导致脓肿复发并破溃，腔内逐渐被肉芽组织增生填满，这些肉芽组织会逐渐变成条索状、发硬的纤维化组织即瘘管，从而形成肛瘘。具体来说，当手术未能完全清除感染源或术后伤口护理不佳，使得感染再次发生，就可能引发脓肿的再次形成，之后随着病情发展就会出现瘘管。
二、排便异常：部分人在肛周脓肿手术后，由于瘢痕愈合形成增生的肉芽组织，在排便时可能会出现异常状况，比如可能引起排便困难等。这是因为瘢痕处的肉芽组织增生可能会影响到肠道的正常通畅性，导致排便过程受到阻碍。
三、直肠黏膜脱垂：也有一部分人在经过肛周脓肿手术后，可能会对周围神经和韧带造成一定损伤，进而表现为周围部分肌肉黏膜出现一定程度的脱垂，比如直肠黏膜等。主要是手术可能对肛周的组织结构产生了影响，使得相关的神经和韧带功能减弱，无法有效支撑肌肉黏膜，从而导致脱垂现象的发生。
总之，肛周脓肿手术可能带来多种后遗症，需要重视预防和应对。