一般而言，检查免疫系统全套主要是对细胞免疫和体液免疫的功能加以检查。具体如下：
一、细胞免疫：
1.T细胞亚群的检测：
(1)像T细胞亚群降低可见于免疫缺陷性疾病，例如艾滋病；而T细胞亚群升高常出现在甲状腺功能亢进症中。同时还包括B细胞分化抗原检测。
(2)细胞因子检测。
(3)自然杀伤细胞的免疫检测。
(4)肿瘤标志物检测，如甲胎蛋白检测、癌胚抗原检测、组织多肽抗原检测等。
二、体液免疫：
1.免疫球蛋白：
(1)免疫球蛋白G，其升高常见于各类慢性感染、慢性肝病等，降低则多见于各种先天性和获得性体液免疫缺陷病、肾病综合征等。
(2)免疫球蛋白A，免疫球蛋白A增高可发生于类风湿性关节炎、肝硬化等，降低常见于反复的呼吸道感染。
2.血清总补体活性测定：血清总补体活性升高可在急性炎症、组织损伤以及某些恶性肿瘤中见到，而血清总补体活性降低可见于肾小球肾炎等。
总之，具体免疫系统检查的项目选择需依据患者的疾病情况来确定。