阴茎珍珠疹一般不需要特殊治疗，它是一种良性病变，对健康没有影响。通常情况下，它会在一段时间后自行消退。但如果患者觉得影响美观，也可以通过一些方法处理。
物理治疗方法
激光治疗：利用激光的高能量烧灼珍珠疹组织，使其碳化、脱落。一般治疗后要保持局部清洁干燥，避免感染，大概1-2周创面能愈合。冷冻治疗：通过低温使珍珠疹组织坏死、脱落。冷冻后局部可能会出现肿胀、水疱等情况，一般1-2周可恢复。
局部外用药情况
咪喹莫特乳膏：有一定的调节免疫作用，可能对珍珠疹有一定效果，但使用时要注意局部皮肤反应，如出现红肿、疼痛等不适要及时停药。不过它不是专门针对阴茎珍珠疹的特效药物，疗效个体差异较大。
日常注意事项
保持局部清洁：每天用温水清洗阴茎部位，保持局部干净卫生，减少污垢等对局部的刺激，有助于珍珠疹的稳定情况。比如每天清洗1-2次，选择温和的清洁产品。避免过度刺激：尽量减少对阴茎珍珠疹部位的摩擦、搔抓等刺激，穿着宽松的内裤，避免局部长期处于潮湿、摩擦的环境中，防止珍珠疹加重或引起不适。