做肾结石手术的费用一般在1万~5万元不等，具体费用会因手术方式、患者病情、医院地区等因素有所不同。
手术方式不同费用有差异
体外冲击波碎石术：
这种手术相对便宜，一般费用在1万~2万元左右。它是通过体外发射冲击波聚焦到结石部位，将结石击碎，然后随尿液排出体外。不过，它适用于结石较小（直径通常小于2厘米）、位置较合适的情况。
输尿管镜碎石取石术：
费用大概在2万~3万元。手术是通过尿道插入输尿管镜，找到结石后用激光等将结石击碎并取出。如果结石较大或者位置复杂，可能费用会有所增加。
经皮肾镜碎石取石术：
费用相对高一些，一般在3万~5万元。该手术需要建立经皮肤到肾脏的通道，然后用肾镜找到结石并击碎取出。对于较大的结石或者复杂肾结石，多会选择这种手术方式，但手术创伤相对大一些，费用也会相应提高。
患者病情影响费用
如果肾结石患者同时合并有其他泌尿系统疾病，比如尿路感染等，需要先治疗并发症，这会增加手术前的检查和治疗费用，进而影响整个肾结石手术的总费用。例如，有严重尿路感染的患者，可能需要先使用抗生素控制感染，这部分额外的费用会让总费用上升。
医院地区差异
在一线城市的三甲医院，做肾结石手术的费用可能会偏高，大概在4万~5万元左右。而在一些县级医院，费用可能相对较低，大概在1万~3万元。这是因为不同地区的医疗成本、物价水平等不同，导致手术费用有差异。