小肚子隐隐作痛可能由多种原因引起，如妇科问题、肠道问题、泌尿系统问题等。
一、妇科相关原因
女性小肚子隐隐作痛可能与妇科疾病有关，像盆腔炎，多发生在性活跃期女性，常伴有阴道分泌物增多、异味等情况；还有子宫内膜异位症，会在经期前后或经期出现疼痛，且可能影响生育。
二、肠道原因
肠道方面的问题也可导致小肚子隐痛，比如肠易激综合征，与精神因素、饮食等有关，表现为腹痛伴排便习惯改变；还有肠炎，可能因细菌、病毒感染等引起，除了腹痛，还可能有腹泻、腹胀等症状。
三、泌尿系统原因
泌尿系统问题也会引发小肚子隐痛，例如膀胱炎，常伴有尿频、尿急、尿痛等症状；输尿管结石，除了小肚子隐痛，还可能有腰部放射痛、血尿等表现。
四、其他原因
腹部着凉、过度劳累等也可能导致小肚子隐隐作痛。腹部着凉会使肠道痉挛引起疼痛，过度劳累可能影响身体的正常机能从而出现隐痛情况。对于不同原因导致的小肚子隐痛，需要进一步检查明确，如妇科检查、肠镜、尿常规等。如果是女性，要特别关注自身月经等情况，若疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，应及时就医。