指甲上出现凹陷可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：缺乏某些营养素，如铁、蛋白质、维生素等，可能导致指甲营养不良，出现凹陷。
2.甲癣：由真菌感染引起，会导致指甲变形、增厚、凹陷等。
3.银屑病：这是一种慢性炎症性皮肤病，指甲病变是其常见表现之一，可出现甲板凹陷、增厚、变色等。
4.扁平苔藓：一种自身免疫性疾病，可累及皮肤和黏膜，指甲病变表现为甲板变薄、凹陷、纵嵴等。
5.湿疹：皮肤炎症性疾病，可能影响指甲，导致指甲凹陷。
6.外伤：指甲受到外伤，如挤压、碰撞等，可能导致指甲下出血，形成凹陷。
7.其他：某些系统性疾病，如雷诺病、心脏病等，也可能引起指甲凹陷。
如果发现指甲有凹陷，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会建议进行以下检查：
1.皮肤镜检查：观察指甲及周围皮肤的形态、颜色等，有助于诊断甲癣、扁平苔藓等疾病。
2.真菌培养：如果怀疑是真菌感染，需要进行真菌培养以明确诊断。
3.自身抗体检测：对于自身免疫性疾病，如银屑病、扁平苔藓等，需要进行自身抗体检测。
4.其他检查：根据具体情况，医生可能还会建议进行血常规、微量元素检查等。
治疗方法因病因而异。以下是一些可能的治疗措施：
1.补充营养：如果是营养不良导致的指甲凹陷，需要补充相应的营养素，如铁、蛋白质、维生素等。
2.抗真菌治疗：如果是甲癣，需要使用抗真菌药物进行治疗。
3.免疫调节治疗：对于自身免疫性疾病，如银屑病、扁平苔藓等，需要使用免疫调节药物进行治疗。
4.治疗原发病：如果指甲凹陷是其他系统性疾病的表现，需要积极治疗原发病。
5.注意指甲护理：保持指甲清洁、干燥，避免过度修剪指甲，避免接触刺激性物质。
总之，指甲上出现凹陷可能是多种疾病的表现，需要及时就医，明确诊断，采取相应的治疗措施。同时，注意指甲护理，保持健康的生活方式，有助于促进指甲的健康。