生理性卵巢囊肿和病理性卵巢囊肿，一般可通过临床表现、查体以及辅助检查来加以区分，具体如下：
一、临床表现
1.生理性囊肿：患者通常没有显著症状，体检时可能之前未发现有卵巢囊肿或者囊肿时而出现时而消失。
2.病理性囊肿：持续存在，且随着囊肿不断增大，会有尿频、尿急或便秘等状况出现。若是恶性卵巢囊肿，患者多有腹胀、腹部肿块等表现。
二、辅助检查
1.妇科B超检查：生理性囊肿经妇科B超检查通常小于5厘米，一般两三个月后会逐渐消失。
2.病理学检查：这是鉴别囊肿性质的金标准，通过对病理切片进行分析可明确判断卵巢囊肿的性质。
患有卵巢囊肿的女性，一定要及时前往医院就诊。除了病史和化验检查外，医生的内诊也极为重要，需要由专业医生依据具体情况进行综合判断，并根据诊断结果进行针对性治疗，以免耽误病情。
总结：主要讲述了区分生理性和病理性卵巢囊肿的方法，包括临床表现和辅助检查方面，同时强调患卵巢囊肿后及时就医的重要性。