三个月宝宝吐舌头的原因主要有以下几种：
一、正常的生理现象：三个月的宝宝处在生长发育进程中，会通过吐舌头去感知外界，或者当宝宝流口水时会伸出舌头舔口水。这些均属于正常生理现象，无需进行治疗干预，通常过段时间就会自然停止。
二、口腔疾病：例如口腔溃疡、鹅口疮等。这些疾病会引发口腔疼痛症状，所以宝宝会通过吐舌头来表达不适。具体来说：
1.口腔溃疡：如果宝宝患有口腔溃疡，可以遵医嘱给宝宝补充维生素C，局部使用冰硼散，同时要注意口腔的清洁卫生。
2.鹅口疮：对于有鹅口疮的宝宝，可以遵医嘱使用制霉菌素进行治疗。
三、其它疾病：像脑瘫，脑瘫会致使智力发育迟缓，让宝宝不能很好地控制自身行为，进而出现吐舌头表现。目前针对脑瘫并无特效治疗药物，主要通过生活指导来改善症状，比如对宝宝进行有针对性的训练和引导，指导宝宝改正吐舌头的习惯。
总之，如果发现宝宝长时间经常吐舌头或还伴有其他异常症状，应及时带宝宝前往医院进行检查和治疗，以明确具体原因并采取相应的措施。