手足口病主要是由肠道病毒引起的，其中以柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型最为常见。它主要通过以下几种途径传播导致感染。
传播途径一：密切接触传播
接触患者的分泌物： 手足口病患者的唾液、疱疹液和粪便中都含有病毒。比如，健康儿童与手足口病患儿一起玩耍时，接触到患儿被污染的玩具、餐具、毛巾等物品，就有可能感染病毒。如果患儿咳嗽、打喷嚏时产生带有病毒的飞沫，健康儿童吸入后也可能被传染。直接接触患者皮肤： 与手足口病患者直接皮肤接触，比如拥抱、亲吻等，也容易让病毒传播开来。
传播途径二：呼吸道飞沫传播
空气传播病毒： 当手足口病患者说话、咳嗽或者打喷嚏时，会产生含有病毒的飞沫，这些飞沫在空气中悬浮，健康人吸入后，病毒就有可能在呼吸道黏膜处定植并引发感染。一般来说，在人群密集、通风不好的场所，这种呼吸道飞沫传播的风险会更高。
传播途径三：饮食传播
食用被污染的食物： 食用被肠道病毒污染的食物也会感染手足口病。例如，喝了被病毒污染的水，或者吃了被病毒污染的生冷食物，像未洗净的水果、未煮熟的肉类等，都可能让病毒进入人体消化道，从而引发感染。