消化不良一般不会引起发热，但若消化不良合并急性胃肠炎、急性胆囊炎、急性胰腺炎等疾病时则可能出现发热情况，且治疗方法各异，处方药需遵医嘱使用。具体如下：
一、急性胃肠炎：主要因自身免疫力低、饮食不节、感染等因素所致。患者感染细菌、病毒等致病微生物后引发炎症反应，炎症物质会干扰体温调节中枢而致发热，同时还伴有腹痛、消化不良等症状。治疗上要注重补液，可使用口服补液盐散，若有腹泻可用蒙脱石散止泻。饮食方面，患者需清淡饮食，避免辛辣油腻食物，多喝温水。
二、急性胆囊炎：主要由结石、感染、化学刺激、饮食不当等导致。当急性胆囊炎患者遭受细菌感染时会出现炎症反应从而引起发热。急性胆囊炎患者通常胆汁排出和浓缩功能受损，致使机体消化功能下降，出现消化不良。治疗时，患者可使用阿莫西林胶囊、头孢克洛胶囊、左氧氟沙星片等药物。体温低于38.5℃可采用冰袋、全身温水擦浴等方式降温，高于38.5℃则需使用布洛芬片、对乙酰氨基酚片等药物。
三、急性胰腺炎：由多种原因致使胰酶异常激活，引起胰腺组织自身消化而致，主要表现为突然发作的持续性上腹部疼痛，可伴有恶心、呕吐、腹胀、发热等，部分患者还会有胰腺外分泌功能不足导致消化不良。治疗上需禁食禁饮、胃肠内减压，使用醋酸奥曲肽、乌司他丁等药物。
此外，这种情况也可能由炎症性肠病引起，建议患者及时到医院就诊，在医生指导下进行治疗。
总之，当消化不良伴有发热时，应考虑可能合并有其他疾病，要及时就医明确原因，并采取相应的治疗措施。