月经结束第二天同房有怀孕可能。具体如下：
一、虽然怀孕可能性较小，但仍有可能怀孕。如果女性月经规律且经期较短，此时处于安全期范畴，怀孕可能性相对较低；但要是女性月经不规律且经期缩短，就可能排卵，从而有怀孕的可能。
二、如果不想怀孕，即使是月经结束第二天同房也需做好避孕措施。
三、还需注意个人卫生，此时不宜过早进行性生活，因为月经结束第二天可能尚未完全恢复，同房可能导致病原体入侵，对身体产生不良影响。
总之，月经结束第二天同房并非绝对安全，需要综合多方面因素考虑，采取相应措施来避免意外怀孕和保护身体健康。