如果被狗咬后伤口有隐隐作痛的感觉，可能是因为局部肌肉损伤肿痛、伤口感染等原因导致的。此外，被狗咬伤后还需要进行相应处理，具体如下。
一、肌肉损伤肿痛
狗咬伤往往会伴有周围血管不同程度的挫裂伤，进而出现组织水肿、皮下出血、血肿以及肌肉软组织损伤等情况，这就会致使局部疼痛。对此，可以进行局部冷敷，以防止皮下血肿扩散，通常这种疼痛会自行缓解。
二、伤口感染
被狗咬后若有皮肤破损、出血等状况会引发疼痛，倘若没有及时处理，可能会造成伤口感染。如果患者伤口感染程度较轻，局部仅有轻度的红肿、疼痛，可以通过外用莫匹罗星软膏等，来促进局部炎症因子吸收，减轻肿胀和疼痛症状，同时改善伤口处的血液循环，以促使伤口早日愈合。要是感染范围较大，且局部伴有明显的红肿、疼痛等，可以外用石脂软膏来促进伤口内炎性病灶较快吸收。这些措施都能有效缓解疼痛症状。必要时，还可遵医嘱使用青霉素等抗生素药物进行抗感染治疗。
此外，对于被狗咬伤的伤口处理：
1.如果体表无任何痕迹，皮肤完整且无任何破损，属于Ⅰ级暴露。这种情况只需在家用清水冲洗消毒即可，无需到医疗机构去注射狂犬疫苗。
2.若咬伤后有痕迹但没出血，属于Ⅱ级暴露，需要到医疗机构让医生判断是否需要注射狂犬疫苗。
3.Ⅲ级暴露是指被狗咬伤后，皮肤出现明显的出血、破损，这就需要在24小时内注射狂犬疫苗。如果伤口较严重，伴有大面积皮肤撕裂伤的还需要进行伤口的清创和破伤风抗毒素局部的注射。
总结：被狗咬后伤口隐痛可能是肌肉损伤或感染导致，要根据具体情况进行处理，同时要依据伤口情况判断暴露等级并进行相应处置。