治疗角膜炎适合的眼药水需根据病因来选择，一般细菌性角膜炎常用左氧氟沙星滴眼液等，这类眼药水能有效抑制细菌生长，通常用药后可在一定时间内改善症状；病毒性角膜炎常用更昔洛韦滴眼液等，可针对病毒发挥作用。
细菌性角膜炎适用眼药水
左氧氟沙星滴眼液： 属于喹诺酮类抗生素，通过抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而达到杀菌效果。它对多种引起细菌性角膜炎的常见细菌有良好的抗菌活性，比如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等引起的角膜炎。一般需要在医生指导下规律用药，用药过程中要注意可能出现的眼部刺激等不良反应。妥布霉素滴眼液： 也是常用的针对细菌性角膜炎的抗生素眼药水，对革兰阴性菌和阳性菌都有作用，能有效对抗铜绿假单胞菌等引起的感染，使用时同样要遵循医嘱，观察眼部反应。
病毒性角膜炎适用眼药水
更昔洛韦滴眼液： 是一种抗病毒药物，它能竞争性抑制病毒DNA多聚酶，并掺入病毒DNA中，终止病毒DNA链的延伸，从而发挥抗单纯疱疹病毒的作用，常用于单纯疱疹病毒性角膜炎的治疗。使用时要注意可能对眼部造成的刺激，比如短暂的灼烧感等。阿昔洛韦滴眼液： 同样是针对疱疹病毒的抗病毒眼药水，通过干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒DNA的合成来发挥作用，可用于治疗病毒性角膜炎，用药时需按照疗程使用，避免自行停药。
真菌性角膜炎适用眼药水
那他霉素滴眼液： 是一种多肽类抗真菌抗生素，通过与真菌细胞膜中的固醇结合，改变细胞膜的渗透性，导致细胞内物质外流，从而抑制真菌生长。它是治疗真菌性角膜炎的常用药物之一，不过使用时需要较长的疗程，且要密切监测眼部情况，因为可能会引起眼部的过敏等反应。氟康唑滴眼液： 属于三唑类抗真菌药物，通过抑制真菌细胞色素P450依赖酶，影响真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用，可用于敏感真菌引起的角膜炎，但使用时要注意药物可能带来的眼部刺激等问题。