孕酮低可能由多种原因造成。一般来说，女性黄体功能不全是常见原因之一，黄体功能不全时，黄体分泌的孕酮量会不足。另外，内分泌系统出现紊乱也可能导致孕酮低，比如甲状腺功能异常等情况可能影响孕酮的分泌。还有些女性是因为患有一些疾病，像多囊卵巢综合征等，也会引发孕酮水平降低。
黄体相关因素导致孕酮低
卵巢黄体发育不全：卵巢的黄体是分泌孕酮的重要结构，如果黄体本身发育不全，就会使得孕酮的分泌量减少。正常情况下，黄体形成后会分泌一定量的孕酮来维持妊娠等生理过程，若黄体发育不好，就无法产生足够的孕酮。黄体期异常：女性的黄体期一般有一定的时间范围，如果黄体期出现异常，比如黄体期缩短等情况，也会影响孕酮的分泌量。正常黄体期大概在14天左右，若黄体期缩短，孕酮分泌就会不足。
内分泌系统紊乱引发孕酮低
甲状腺功能异常：甲状腺是人体重要的内分泌器官，甲状腺功能亢进或者减退都会影响到整个内分泌系统的平衡，进而可能影响孕酮的分泌。例如甲状腺功能减退时，身体的代谢等多种功能受到影响，可能导致孕酮水平降低。其他内分泌腺体问题：像肾上腺等内分泌腺体出现问题，也可能间接影响到孕酮的分泌。因为内分泌系统是一个复杂的整体，各个腺体之间相互协调，任何一个环节出现问题都可能波及孕酮的分泌。
疾病因素导致孕酮低
多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，患有多囊卵巢综合征的女性，通常存在排卵障碍等问题，而排卵异常会影响到孕酮的分泌，使得孕酮水平偏低。而且这类患者往往内分泌失调比较明显，进一步加重孕酮低的情况。其他妇科疾病：一些妇科疾病，如子宫内膜异位症等，也可能影响到孕酮的分泌，导致孕酮水平降低。子宫内膜异位症会改变子宫内的环境等多种因素，从而干扰孕酮的正常分泌过程。