50天婴儿感冒咳嗽，可在医生指导下使用以下药物：
1.抗病毒药物：如果是由病毒感染引起的感冒咳嗽，医生可能会开利巴韦林、抗病毒口服液等药物。
2.抗生素：如果感冒咳嗽是由细菌感染引起的，医生可能会开抗生素，如阿莫西林、头孢克洛等。
3.止咳祛痰药：如氨溴索、氨溴特罗等，可帮助减轻咳嗽症状，促进痰液排出。
4.抗组胺药：对于过敏引起的感冒咳嗽，医生可能会开氯雷他定、西替利嗪等抗组胺药。
需要注意的是，婴儿的身体器官发育尚未完全，对药物的代谢和耐受性较差。因此，在给婴儿使用药物时，必须严格按照医生的建议用药，不要自行增减剂量或更换药物。同时，要注意观察婴儿的病情变化，如果症状加重或出现其他异常，应及时就医。