溃疡性结肠炎的治疗药物有多种，氨基水杨酸制剂是常用的一类，像柳氮磺吡啶，一般需要连续服用数周甚至数月来控制炎症。
氨基水杨酸制剂类
美沙拉嗪： 有口服剂型也有栓剂、灌肠剂等局部剂型。口服美沙拉嗪能在肠道内缓慢释放药物，作用于结肠炎症部位；栓剂和灌肠剂则直接作用于直肠和乙状结肠的病变黏膜，局部浓度高，能更好地缓解局部炎症。奥沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂的一种，它在结肠部位被细菌分解为两分子的5 - 氨基水杨酸，从而发挥抗炎作用，对轻、中度的溃疡性结肠炎有一定疗效。
糖皮质激素
泼尼松： 属于全身性应用的糖皮质激素，对于中重度的溃疡性结肠炎患者，在氨基水杨酸制剂疗效不佳时可使用。一般起始剂量为每日30 - 60毫克，根据病情逐渐调整剂量，但长期使用可能会有较多副作用，如骨质疏松、血糖升高、感染风险增加等。布地奈德： 是局部作用的糖皮质激素，主要用于病变局限在直肠、乙状结肠的溃疡性结肠炎患者。它在肠道局部发挥抗炎作用，全身副作用相对较小，因为它首先经过肝脏首过代谢，进入全身循环的药量较少。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳或激素依赖的溃疡性结肠炎患者。一般需要连续服用数月甚至更长时间才能发挥作用，常见的副作用有骨髓抑制、肝损害等，用药期间需要定期监测血常规和肝功能。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也可用于溃疡性结肠炎的治疗，尤其适用于对硫唑嘌呤不耐受的患者。同样需要监测血常规、肝功能等指标，以评估药物的安全性和疗效。
生物制剂
英夫利昔单抗： 属于抗肿瘤坏死因子 - α的生物制剂，对于重度的、对传统治疗药物无效的溃疡性结肠炎患者可以考虑使用。一般需要通过静脉输注给药，使用前需要进行结核等感染筛查，因为使用后可能会增加感染的风险。不过这类药物价格相对较高，且有一定的输注反应等风险需要关注。