非经期褐色分泌物合并腰疼，可能与以下原因有关。
1.排卵期出血：如果非经期褐色分泌物发生在两次月经中间，量少，可能是排卵期出血。排卵后，体内雌激素水平下降，子宫内膜失去激素支持，可能出现部分脱落，引起出血。此外，排卵时，卵泡破裂可能导致卵巢表面小血管破裂，也会出现少量出血。排卵期出血通常持续2-3天，可伴有轻微腹痛或腰疼。
2.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、盆腔炎等，都可能导致非经期褐色分泌物和腰疼。这些炎症可能由细菌、真菌、病毒等感染引起，也可能与内分泌失调、免疫力下降等因素有关。
3.节育环：如果放置节育环后出现非经期褐色分泌物和腰疼，可能是节育环引起的副作用。节育环可能刺激子宫内膜，导致炎症反应，或引起子宫收缩，从而出现这些症状。
4.内分泌失调：内分泌失调也可能导致非经期褐色分泌物和腰疼。例如，黄体功能不足、多囊卵巢综合征等，可能导致孕激素分泌不足，使子宫内膜不能及时修复，引起出血。
5.其他：子宫内膜息肉、子宫肌瘤、宫颈癌、子宫内膜癌等妇科疾病，以及内分泌系统疾病、外伤、节育环移位等，也可能引起这些症状。
如果出现非经期褐色分泌物和腰疼，建议及时就医，进行妇科检查、B超检查、激素水平测定等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。此外，在就医前，应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活和盆浴。同时，应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。