手足口病多数可治愈且无显著后遗症，不必过度担忧，积极治疗即可。手足口病依据疾病发展程度可分为出疹期、神经系统受累期、心肺功能衰竭前期和心肺功能衰竭期，严重程度各异，对预后影响也不同，不过经积极治疗通常能痊愈。
一、出疹期：主要表现为发热，手、足、口、臀等部位出疹，同时可能伴有咳嗽、流涕、食欲不振等症状。在这个阶段，患儿会出现体温升高，且手、足、口腔以及臀部等位置会有疹子长出，此外还可能有咳嗽、流鼻涕以及食欲不佳等情况。
二、神经系统受累期：少数病例会出现中枢神经系统损害，具体表现为精神差、嗜睡、吸吮无力、易惊、头痛、呕吐、烦躁、肢体抖动、肌无力、颈项强直等症状。此阶段有一小部分病例的中枢神经系统会遭到损害，其精神状态不好、容易嗜睡、吸吮动作没有力气、容易受惊、有头痛现象、会呕吐、情绪烦躁、肢体出现抖动、肌肉无力、脖颈强直等。
三、心肺功能衰竭前期：主要表现为心率和呼吸增快、出冷汗、四肢末梢发凉、皮肤发花、血压升高等。该阶段主要呈现出心跳和呼吸频率加快、出冷汗、四肢末端发凉、皮肤呈现花斑样、血压升高之类的表现。
四、心肺功能衰竭期：主要表现为心动过速、呼吸急促、口唇紫绀、咳粉红色泡沫痰或血性液体、血压降低或休克等。在这个时期主要的症状为心跳过快、呼吸急促、嘴唇发紫、咳出粉红色泡沫痰或者血性液体、血压降低或者出现休克等。
通常普通手足口病患儿在门诊治疗就行，要注意隔离，做好口腔和皮肤护理，还可应用布洛芬混悬液等药物来缓解不适，多数预后良好，通常一周左右能够恢复。而重症患儿则需要尽快就医处理，对神经系统受累者，使用甘露醇等脱水利尿剂降低颅内高压，还可酌情使用糖皮质激素和免疫球蛋白，并给予降温、镇静、止惊等对症治疗，经治疗后通常疾病也能痊愈。
总体来说，手足口病虽然有不同发展阶段和表现，但只要正确处理，多数情况下是能够有效治疗的。