肛门镜检查时一般会有一定程度的不适，但多数人都可以耐受，并不会特别疼痛。通常检查时不适感持续时间较短，几秒到几分钟不等。
检查时的感受因素
个体差异影响：不同人对肛门镜检查的感受不同。比如身体较为敏感的人可能感觉相对明显些，而身体耐受性较好、肛门括约肌比较松弛的人感受可能轻一些。一般来说，大多数人只会感觉到轻微的坠胀感或者短暂的不适，并不会有剧烈疼痛。
检查前准备对感受的影响
肠道准备情况：检查前如果肠道清洁做得好，肠道内没有过多粪便等物质，检查时肛门镜进入相对顺利，不适感相对会轻一些。如果肠道准备不充分，肠道内有较多粪便残留，在插入肛门镜时可能会增加不适感，但这不是疼痛，而是一种异物刺激的感觉。心理因素影响：紧张焦虑的情绪会使肛门括约肌处于紧张状态，这样在进行肛门镜检查时，会感觉更不适。所以检查前放松心情很重要，可通过深呼吸等方式来缓解紧张情绪，有助于减轻检查时的不适感。
检查后的注意事项
轻微不适缓解：检查后可能会有短暂的肛门坠胀感等轻微不适，一般短时间内会自行缓解。要注意休息，短时间内避免剧烈运动。同时要保持肛门局部清洁，可以用温水轻轻清洗肛门周围，保持干燥。如果检查后出现持续较剧烈疼痛或者有出血等异常情况，要及时告知医生进行处理。