胃肠功能紊乱的症状较多，常见的有腹痛，约有50% - 70%的胃肠功能紊乱患者会出现不同程度的腹痛，疼痛部位不固定，一般在脐周等部位。
消化系统症状表现
腹胀： 患者常自觉腹部胀满不适，进食后可能加重。比如有些患者吃少量食物就会感觉肚子很胀，持续时间可长可短，有的能持续数小时甚至数天。恶心呕吐： 部分胃肠功能紊乱患者会出现恶心症状，严重时可能伴有呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般不含有胆汁等其他异常成分，但频繁呕吐可能导致患者脱水等情况。食欲减退： 患者对食物的欲望降低，不想吃饭，食量明显减少，长期食欲减退可能会引起体重下降等问题。
全身症状表现
疲劳乏力： 由于胃肠功能紊乱影响营养的正常消化吸收，患者容易感到疲劳，即使经过充分休息，也难以恢复精力，日常活动容易感到力不从心。失眠多梦： 胃肠功能紊乱可能会影响神经系统的调节，导致患者出现睡眠障碍，表现为入睡困难、多梦、易醒等，长期失眠多梦会进一步影响患者的精神状态和身体恢复。
精神心理症状表现
焦虑抑郁： 很多胃肠功能紊乱患者会伴有焦虑、抑郁等情绪问题。比如常常担心自己的病情是否严重，情绪低落，对周围事物缺乏兴趣等。焦虑和抑郁情绪又可能反过来加重胃肠功能紊乱的症状，形成一种恶性循环。情绪易激惹： 患者的情绪比较敏感，容易因为一些小事而出现情绪波动，变得容易生气、发火，一点小刺激就可能引发较大的情绪反应。