血管瘤的发生主要与血管生成相关因素异常有关，如胚胎发育过程中血管生成调控机制出现紊乱等。
先天性因素
胚胎发育早期，血管形成相关基因发生突变或异常表达，影响血管正常分化与发育，从而引发血管瘤。例如某些血管生成相关基因的缺失或过度激活，可能导致局部血管异常增殖形成血管瘤。
激素因素
部分血管瘤的发生与体内激素水平变化有关。在婴幼儿中，雌激素水平的波动可能影响血管的生长和发育。研究发现，女性血管瘤患儿相对男性可能有一定激素相关差异，雌激素可能通过作用于血管内皮细胞等，促进血管异常增殖。
环境因素
孕期母亲的一些不良环境因素可能增加婴儿患血管瘤的风险。如母亲在孕期接触某些化学物质、受到辐射等，这些环境因素可能干扰胚胎期血管的正常发育过程，导致血管瘤形成。
血管生成因子失衡
体内存在血管生成促进因子和抑制因子，当两者失衡时易引发血管瘤。例如血管内皮生长因子等促进因子过度表达，而血管生成抑制因子相对不足，使得血管内皮细胞异常增殖，形成血管瘤样病变。