早晨起来恶心可能由多种原因引起。比如，慢性咽炎患者早晨起来可能会有恶心的感觉，据统计，约有10% - 20%的人群患有慢性咽炎，早晨起床后由于咽喉部黏膜受到刺激，容易出现恶心症状。
一、胃部疾病导致
胃炎： 各种原因引起的胃炎，如幽门螺杆菌感染引发的胃炎，在早晨时胃酸分泌相对增多，刺激胃黏膜，就可能导致恶心。患者可能还伴有上腹部不适、隐痛等症状。胃溃疡： 胃溃疡患者早晨起来也可能恶心，一般还会有周期性、节律性的上腹痛，疼痛多在进食后一段时间出现。
二、肝胆疾病相关
胆囊炎： 胆囊炎患者早晨起来也可能恶心，尤其是在进食油腻食物后容易诱发。胆囊炎发作时，除了恶心，还可能有右上腹疼痛、发热等表现。肝炎： 肝炎患者肝功能受损，早晨起来可能出现恶心症状，同时可能伴有乏力、黄疸（皮肤和巩膜发黄）等表现。比如病毒性肝炎，有一定的传染性。
三、耳鼻喉科相关因素
鼻窦炎： 鼻窦炎患者鼻腔分泌物在夜间可能倒流至咽部，早晨起来刺激咽部，引起恶心。患者还可能有鼻塞、流涕、头痛等症状。扁桃体炎： 慢性扁桃体炎患者，扁桃体隐窝内有细菌、炎性分泌物等，早晨起来可能刺激咽部导致恶心，同时扁桃体可能肥大、充血等。
四、妊娠因素
育龄期女性早晨起来恶心要考虑妊娠可能，一般在停经6周左右出现，还可能伴有嗜睡、乏力、食欲减退等症状，这是因为怀孕后体内激素变化引起的。