菌阴肺结核指的是肺结核痰抗酸染色呈阴性，这通常意味着患者有传染性的可能较小，多数患者无传染性，但即便如此，仍有少数患者可能具有传染性。
一、没有传染性：肺结核有无传染性取决于患者是否向体外排菌。若肺结核患者痰液中不存在结核菌，那就表明不会传染。对于菌阴肺结核患者，如果反复查痰抗酸染色均为阴性，很大程度上说明痰液内可能没有结核菌，即多数情况下患者并不向体外排菌，所以没有传染性。
二、有传染性：少数肺结核患者会间断地向体外排菌，即使连续三次痰抗酸染色为阴性，也只是表明排菌的可能性极小，不能确定每次咳痰都没有结核菌排出，因而仍可能有传染性。此外，痰抗酸染色还可能出现假阴性结果，若通过结核杆菌基因检测发现病菌，那就说明痰液中可能存在少量结核分枝杆菌，同样可能有传染性。
综上所述，菌阴肺结核在大多数情况下不会传染，但不能完全排除存在较弱传染性的可能。