再障性贫血的治疗需综合多种方法。一般来说，免疫抑制治疗是常用手段之一，比如抗淋巴细胞球蛋白（ALG）或抗胸腺细胞球蛋白（ATG），部分患者通过这类治疗能获得一定疗效。
免疫抑制治疗方面
抗淋巴细胞球蛋白（ALG）： ALG是从免疫动物的血清中提取的免疫球蛋白，能选择性地抑制T淋巴细胞的功能，从而调节免疫系统，对部分再障性贫血患者有作用。抗胸腺细胞球蛋白（ATG）： ATG与ALG类似，也是通过作用于T淋巴细胞来发挥免疫抑制作用，可用于年龄较大或不宜进行造血干细胞移植的再障性贫血患者。
促造血治疗方面
雄激素： 雄激素是常用的促造血药物，如司坦唑醇等。雄激素可以刺激肾脏产生促红细胞生成素，同时直接刺激骨髓造血，促进红细胞的生成。一般需要较长时间用药，可能数月才能见到效果。造血生长因子： 例如重组人粒细胞集落刺激因子（G-CSF），可以促进粒细胞的增殖、分化和释放，有助于提高患者的粒细胞水平，减少感染风险；重组人红细胞生成素（EPO）能刺激骨髓红系造血，促进红细胞生成。
造血干细胞移植方面
适合人群： 对于年龄较轻（一般小于40岁）、有合适供髓者的重型再障性贫血患者，造血干细胞移植是一种可能根治的方法。供髓者一般首选人类白细胞抗原（HLA）相匹配的同胞兄弟姐妹。移植过程： 移植前需要进行严格的预处理，摧毁患者原有的免疫系统和异常造血组织，然后输入供者的造血干细胞，使其重建正常的造血和免疫功能。但移植也存在一定风险，如感染、移植排斥等并发症。
支持治疗方面
预防感染： 再障性贫血患者由于全血细胞减少，免疫力低下，容易发生感染。要注意保持患者居住环境的清洁卫生，减少探视人员，患者自身也要注意个人卫生，如勤洗手等。如果发生感染，要及时根据感染病原体选用合适的抗生素进行治疗。成分输血： 根据患者的具体情况进行成分输血，如患者贫血严重时输注红细胞悬液，血小板严重减少有出血倾向时输注血小板等。但长期成分输血可能会导致一些输血相关并发症，如铁过载等问题。