治食管反流常用的药物有抑酸药等，比如质子泵抑制剂是治疗食管反流的常用药物之一，像奥美拉唑等，一般能在一定程度上缓解症状。
抑酸药物：
质子泵抑制剂：这类药物能强效抑制胃酸分泌，比如奥美拉唑，它可以有效减少胃酸对食管黏膜的刺激，通常能在一定程度上改善食管反流引起的烧心、反酸等症状。不过，长期使用可能需要注意一些潜在影响，比如可能影响维生素B12的吸收等情况。H₂受体拮抗剂：像雷尼替丁，它通过抑制组胺对H₂受体的作用来减少胃酸分泌，也可用于缓解食管反流带来的不适，但相对质子泵抑制剂，其抑酸作用稍弱一些。
促胃肠动力药物：
多潘立酮：它能促进胃肠道蠕动，加快胃排空，从而减少胃内容物反流至食管的机会。不过，对于一些有心脏基础疾病的患者要谨慎使用，因为可能会有一定的心脏相关风险。莫沙必利：同样是促进胃肠动力的药物，它可以增强食管下括约肌压力，促进胃排空，改善食管反流症状，相对来说副作用可能相对较小，但也需要根据患者具体情况来使用。
黏膜保护剂：
铝碳酸镁：它可以中和胃酸，同时在食管黏膜表面形成保护屏障，减轻胃酸、胆汁等对食管黏膜的损伤，缓解烧心、胃痛等症状，而且服用比较方便，一般可以在饭后1 - 2小时或睡前服用。硫糖铝：它能在溃疡面或炎症处形成保护膜，保护食管黏膜免受刺激，有助于食管反流引起的黏膜损伤修复，但服用时要注意按照正确方法，比如要嚼碎后服用等。