目前临床上尚未有能根治系统性红斑狼疮的药物，不过大部分患者可通过药物治疗来缓解病情。系统性红斑狼疮的临床治疗着重强调早期诊断与早期治疗。需依据病情严重程度运用不同药物进行治疗，常用药物包含非甾体抗炎药、抗疟药等。
一、非甾体抗炎药：系统性红斑狼疮发病时，可能会导致机体出现诸多炎症表现，比如关节炎症、肌炎等。在症状较轻且未累及主要器官时，建议在医生指导下选用非甾体抗炎药，此类药物具有抗炎、止痛、退热等功效，能够在一定程度上控制炎症发展，从而缓解病情。临床上常用的有吲哚美辛、塞来昔布等。
二、糖皮质激素类药：在系统性红斑狼疮的诱导缓解期，可使用适量糖皮质激素，因为这类激素药有着良好的抗炎、抗过敏等作用，能在一定程度上使病情趋于稳定，实现诱导缓解的效果，常用药物包括甲泼尼龙、泼尼松等。
三、免疫抑制剂：由于系统性红斑狼疮属于免疫复合物介导的疾病，当病情较重或是难治性病例时，给予免疫抑制剂，能够在一定程度上控制系统性红斑狼疮的发展，保护脏器功能，降低复发风险，常用的有硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等。
四、生物制剂：鉴于系统性红斑狼疮属于自身抗体的弥漫性疾病，而生物制剂可对细胞因子起到一定调节作用，因而能使病情得到改善，对细菌、病毒感染也具有一定治疗效果，常用的有丙种球蛋白等药物。
此外，若系统性红斑狼疮患者出现反复性血栓，可能需要进行长期或终身的抗凝治疗，常用药物为阿司匹林、华法林等。
总结：对于系统性红斑狼疮的治疗，要根据具体病情选择合适的药物，包括非甾体抗炎药、糖皮质激素、免疫抑制剂、生物制剂等，同时针对出现血栓的情况要及时进行抗凝治疗。