小宝宝拉肚子时，应根据病因选择效果好的药物，主要包括肠道益生菌、肠道黏膜保护剂、抗肠黏膜腺体分泌的药物等，必要时遵医嘱应用抗生素。具体如下：
一、如果小宝宝拉肚子是消化不良、肠道病毒感染等常见原因导致的，效果较好的药物主要有：
1.肠道益生菌可调节肠道菌群，如双歧杆菌四联活菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等；
2.肠道黏膜保护剂能减轻腹泻症状，比如蒙脱石散。这些药物可以明显改善症状。若腹泻明显，在医师指导下还可使用抗肠道腺体分泌的药物进行治疗，例如消旋卡多曲等，有助于腹泻的改善。
二、要是小宝宝拉肚子与肠道细菌感染有关，大便可能会出现黏液、血液等情况，此时效果较好的药物主要是抗生素，可在医师指导下使用头孢克肟、头孢地尼等，以避免感染扩散。
总之，对于小宝宝拉肚子的情况，需要明确具体病因后选择合适的药物来进行治疗，以尽快缓解症状，促进恢复。同时，要注意观察小宝宝的病情变化，如有异常应及时就医。