先兆流产的发生往往涉及多种因素，大约15%的临床妊娠会发生先兆流产。
染色体异常因素
胚胎染色体异常： 这是导致先兆流产的常见原因之一。约50% - 60%的早期自然流产是由于胚胎染色体异常引起的。比如染色体数目异常，像21 - 三体、18 - 三体等，或者染色体结构异常，都会影响胚胎的正常发育，从而引发先兆流产。
母体因素影响
内分泌失调方面
黄体功能不全： 女性体内的黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，就不能很好地支持子宫内膜，使得胚胎着床和发育受到影响，进而增加先兆流产的风险。据统计，因黄体功能不全导致先兆流产的占相当比例。甲状腺功能异常： 甲状腺功能减退或亢进都会干扰妊娠的正常进程。甲状腺功能减退时，机体内分泌环境紊乱，可能影响胚胎的生长发育；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会对妊娠产生不利影响，增加先兆流产发生的可能性。
生殖器官异常情况
子宫畸形： 如先天性子宫纵隔、双角子宫等子宫畸形，会使子宫的形态和结构异常，影响胚胎的着床位置和生长空间，容易引发先兆流产。例如子宫纵隔的存在，会占据宫腔的正常空间，对胚胎的发育造成限制。子宫肌瘤： 较大的子宫肌瘤会影响子宫的环境，干扰胚胎的种植和发育。尤其是黏膜下子宫肌瘤，对妊娠的影响更为明显，可能导致先兆流产的发生。
免疫因素作用
自身免疫异常： 母体的免疫系统如果出现异常，产生针对胚胎的自身抗体，就会攻击胚胎，导致先兆流产。比如抗磷脂抗体综合征，体内存在的抗磷脂抗体可引起胎盘血管血栓形成，影响胎盘的血液供应，进而影响胚胎发育，引发先兆流产。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫耐受不足，也可能导致先兆流产。正常妊娠时，母体需要对胚胎产生适当的免疫耐受，若这种耐受失衡，就会引发免疫排斥反应，影响胚胎的存活。
外界不良因素干扰
不良生活习惯影响
吸烟与饮酒： 孕妇吸烟或大量饮酒会对胚胎造成损害。香烟中的尼古丁等有害物质以及酒精都会通过胎盘影响胚胎的发育，增加先兆流产的发生几率。有研究表明，吸烟孕妇发生先兆流产的风险明显高于不吸烟的孕妇。过度劳累： 孕妇长期过度劳累，身体处于疲劳状态，会影响身体的内分泌和免疫系统等，使得妊娠环境不稳定，容易引发先兆流产。比如长时间从事重体力劳动或者过度熬夜等情况，都可能增加先兆流产的风险。
环境有害物质接触
化学物质接触： 孕妇接触一些有毒的化学物质，如苯、甲醛等，这些化学物质可能通过皮肤吸收或呼吸道吸入进入体内，干扰胚胎的正常发育，导致先兆流产。在一些化工环境工作的孕妇，若防护不当接触到这类化学物质，发生先兆流产的风险会增加。