新型肺炎主要通过病原学检查、影像学检查和血常规检查等来明确诊断。一般来说，病原学检查中的实时荧光RT-PCR检测鼻咽拭子等标本中新型冠状病毒核酸，是重要的确诊手段之一。
病原学检查
核酸检测： 采用实时荧光RT-PCR方法，从患者呼吸道标本（如鼻咽拭子、痰液等）中检测新型冠状病毒核酸，一般在发病后1-2天内就可能检测到阳性结果，其灵敏度和特异性较高。基因测序： 通过对病毒基因进行测序分析，能确定病毒的毒株类型等信息，有助于了解病毒的传播变异情况，但相对核酸检测，操作更复杂，耗时也更长。
影像学检查
胸部X线检查： 在疾病早期，可能会出现肺部纹理增粗等非特异性表现；随着病情进展，会出现单发或多发的磨玻璃影、浸润影等，严重时可呈现双肺弥漫性病变。一般检查费用相对较低，可初步观察肺部情况。胸部CT检查： 相较于X线，CT对肺部病变的检出更为敏感，能更早发现细微的病灶变化，如早期可能出现的小斑片影及间质改变，进而发展为双肺多发磨玻璃影、浸润影，严重者可出现肺实变，胸腔积液少见。
血常规检查
白细胞计数： 多数患者白细胞总数正常或降低，淋巴细胞计数减少。不过也有少数患者白细胞总数升高，淋巴细胞计数正常或减低。一般发病早期白细胞总数正常或减少，淋巴细胞计数逐渐减少。C反应蛋白（CRP）和血沉： 部分患者CRP和血沉会升高，这有助于判断炎症反应情况，但这些指标不具有特异性，需结合其他检查综合判断。