功能性子宫出血的治疗方法需根据具体情况选择，一般来说可通过药物治疗、手术治疗以及一般治疗等方式来处理。药物治疗方面，常用的有孕激素类药物，像黄体酮，它能使子宫内膜转化为分泌期，从而达到止血的目的。
药物治疗
孕激素药物： 以黄体酮为例，它可以让子宫内膜由增生期转变为分泌期，之后发生撤退性出血，进而起到止血作用。不过，使用这类药物时要注意，需在医生指导下规范用药，避免自行随意调整剂量。雌激素药物： 例如苯甲酸雌二醇，适用于青春期功能性子宫出血，能迅速促使子宫内膜生长，修复创面从而止血，但使用过程中可能会有一些不良反应，需密切关注。
手术治疗
刮宫术： 对于已婚患者来说，诊断性刮宫是常用的方法之一，不仅可以迅速止血，还能将刮出的子宫内膜送病理检查，明确病因。一般在刮宫后的1 - 2天内出血会明显减少。子宫内膜去除术： 适用于药物治疗无效且无生育要求的绝经过渡期功能性子宫出血患者。通过特殊的器械破坏子宫内膜或使其坏死脱落，从而达到止血目的。
一般治疗
休息与营养： 患者要保证充足的休息，避免过度劳累。同时，要注意加强营养，多摄入富含蛋白质、铁等营养物质的食物，如瘦肉、蛋类、菠菜等，以纠正贫血状况，一般建议每天保证摄入足够的蛋白质来维持身体正常机能。纠正贫血： 如果患者有贫血情况，可根据贫血程度补充铁剂等。比如轻度贫血可以通过饮食补充铁元素，而中重度贫血可能需要口服铁剂或者输血治疗，一般血红蛋白低于60g/L时可能需要考虑输血。