再生障碍性贫血的原因较为复杂，可能与多种因素有关。据研究，大约有半数以上的再生障碍性贫血患者病因尚不明确，而能明确的常见原因主要有以下几类。
一、药物因素
化学药物： 一些化学物质可能会引发再生障碍性贫血，比如氯霉素，它在临床应用中被发现可能对骨髓造血干细胞产生抑制作用，从而增加患再生障碍性贫血的风险。还有抗肿瘤的化疗药物，像烷化剂类药物，它们在杀伤肿瘤细胞的同时，也可能对正常的骨髓造血干细胞造成损害，进而导致再生障碍性贫血的发生。
二、病毒感染
肝炎病毒： 部分病毒性肝炎患者可能会发展为再生障碍性贫血。其中，乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒与再生障碍性贫血的关系较为密切。研究发现，感染这些病毒后，病毒可能会直接侵袭骨髓造血干细胞，影响其正常的增殖和分化，导致造血功能出现障碍，最终引发再生障碍性贫血。其他病毒： 如微小病毒B19感染也可能与再生障碍性贫血有关。微小病毒B19主要侵犯骨髓中的红系造血前体细胞，抑制其增殖，从而影响红细胞的生成，长期感染可能会逐步影响整个骨髓的造血功能，引发再生障碍性贫血。
三、辐射因素
电离辐射： 长期接触大剂量的电离辐射会增加患再生障碍性贫血的风险。例如，长期在放射工作环境中且没有做好防护措施的人员，像一些放射科的工作人员，如果受到过量的X射线、γ射线等电离辐射照射，辐射会损伤骨髓造血干细胞和骨髓微环境，导致骨髓造血功能减退，进而引发再生障碍性贫血。一般来说，当人体受到的电离辐射剂量达到一定程度时，就可能逐渐出现造血异常的表现。