指甲盖变颜色可能由多种原因引起，比如甲真菌病，约有30% - 50%的甲病是由甲真菌病导致的。
甲真菌病导致指甲变色
由皮肤癣菌引起：皮肤癣菌感染指甲后，常见指甲颜色改变，如白色浅表型，指甲表面出现白点或白色斑块，逐渐扩大使指甲变脆、增厚。由非皮肤癣菌霉菌引起：这种情况可能导致指甲呈现黄色、褐色等颜色改变，同时指甲质地也会发生变化，变得混浊、肥厚。
外伤导致指甲变色
轻微外伤：如果手指受到轻微碰撞等外伤，甲下可能会有淤血，从而使指甲呈现黑色、暗红色等颜色改变，一般小的淤血会随着指甲生长慢慢消退，大概需要2 - 3个月。严重外伤：严重外伤可能导致甲床损伤，进而影响指甲生长，出现指甲颜色异常、形状改变等情况，需要及时就医处理。
某些 systemic diseases 导致指甲变色
银屑病：约有5% - 10%的银屑病患者会出现甲受累情况，表现为指甲凹陷（像顶针样改变）、指甲变色，可为黄白色、褐色等颜色改变。慢性肾上腺皮质功能减退症：患者可能出现指甲色素沉着，导致指甲颜色加深，同时还可能伴有皮肤色素沉着等其他表现。