目前并没有所谓的“最特效”药物能完全针对植物神经紊乱一蹴而就。植物神经紊乱的治疗需综合多方面因素，常用的药物有调节神经功能的药物，如维生素B族等，维生素B1一般10mg/片，可参与体内辅酶形成，维持神经正常功能，但它只是辅助治疗的一部分。
调节神经功能类药物
维生素B族： 维生素B1、B6、B12等都对植物神经有调节作用。维生素B1参与糖代谢过程，维持神经系统正常功能；维生素B6参与多种代谢反应，对神经递质合成有影响；维生素B12有助于维持神经髓鞘的代谢与功能。谷维素： 它主要作用于间脑的自主神经系统与内分泌中枢，能调整植物神经功能，减少内分泌平衡障碍，改善精神神经失调症状。一般成人一次10 - 30mg，每日3次。
对症治疗药物
失眠相关药物： 如果植物神经紊乱伴有失眠，可使用助眠药物。如艾司唑仑，它是苯二氮䓬类催眠药和镇静药，能引起中枢神经系统不同部位的抑制，但长期使用可能有成瘾性，一般睡前服用1 - 2mg。不过这类药物需在医生指导下使用，尤其要注意老年患者可能对其更敏感。心慌等心脏症状相关药物： 若有心慌等心脏方面的植物神经紊乱症状，对于心率快的情况，可使用β受体阻滞剂，如普萘洛尔，它能竞争性阻断β肾上腺素受体，减慢心率，但哮喘患者禁用，且需注意可能引起低血压等不良反应。
特殊人群用药注意
老年人： 老年人使用调节植物神经药物时要更谨慎。比如维生素B族，一般剂量可遵循常规，但像艾司唑仑等助眠药，老年人对其敏感性增加，初始剂量宜小，从0.5mg开始，观察反应后再调整，因为老年人肝肾功能减退，药物代谢减慢，容易蓄积中毒。孕妇及哺乳期女性： 这类人群使用植物神经紊乱相关药物需格外小心。维生素B族相对安全，但其他药物如谷维素，虽然目前研究显示对胎儿影响不大，但仍需医生评估后使用；对于艾司唑仑等药物，孕妇及哺乳期女性一般禁用，以免通过胎盘或乳汁影响胎儿或婴儿。