咽拭子检测费用一般在几十元到两百元左右。不同地区、不同机构的收费标准会有差异。比如在一些基层医疗机构，咽拭子核酸检测可能收费在30~80元左右；而在一些大型医院或第三方检测机构，费用可能会相对高一些，大概在100~200元上下。
不同检测类型的费用差异
新冠病毒咽拭子检测：
公立医疗机构： 在大部分公立综合性医院进行新冠病毒咽拭子检测，价格通常比较稳定，一般在50~100元左右。这是因为公立医疗机构的收费有相关规定进行规范。第三方检测机构： 一些第三方医学检验所开展的新冠病毒咽拭子检测，费用可能会稍高，大概在80~200元左右。但第三方检测机构可能会有一些优惠活动等情况。
流感病毒咽拭子检测：
普通门诊： 在社区医院等普通门诊进行流感病毒咽拭子检测，费用相对较低，可能在30~60元左右。因为流感病毒检测相对新冠病毒检测复杂程度稍低一些，成本相对也低。专科医院： 如果是在专门的传染病医院进行流感病毒咽拭子检测，费用可能会在50~90元左右。专科医院对于流感病毒检测的设备等配备可能更针对该类疾病，所以费用会有一定差异。
影响咽拭子检测费用的因素
检测项目的复杂程度：
如果是单纯进行一种常见病原体的咽拭子检测，费用相对较低。但如果是同时检测多种病原体，比如同时检测新冠病毒、流感病毒、支原体等多种病原体的咽拭子联合检测，费用就会相应提高。因为多种病原体检测需要更多的试剂、更复杂的检测流程等，成本增加，所以费用也会上升。
地区经济发展水平：
经济发达地区的检测费用相对会高一些，因为当地的人力成本、场地租赁成本等相对较高。而经济欠发达地区，各项成本相对较低，所以咽拭子检测费用也会低一些。例如一线城市的一些医院咽拭子检测费用可能在100~200元，而一些三四线城市的基层医疗机构可能在30~80元。