结膜炎用药三天后感觉更严重可能有多种情况，包括正常现象、眼睛持续感染、用药不当等。
一、正常现象：药物可能具有一定刺激性，结膜炎患者在用药过程中，可能因药物刺激而出现疼痛等表现，从而让部分患者觉得病情似乎更严重了。这通常是用药过程中的正常反应，建议患者继续按医嘱用药，一般用药一周左右，病情多会逐渐缓解。
二、眼睛持续感染：
1.在使用眼药水期间，如果不注重眼睛部位的卫生清洁，常有手揉眼睛的行为，就可能导致感染持续加重，进而出现用药时病情反而加重的情况。
2.平时应做好眼睛部位的卫生防护工作，尽可能避免用手揉眼睛。
3.必要时，患者可及时就医，在医生指导下用生理盐水冲洗眼睛来缓解不适症状。
三、用药不当：
1.若患者自行用药治疗，或者药物剂量使用不足等，都可能出现病情持续加重的现象。
2.此时患者需要再次咨询医生，明确具体的药物用量，然后严格按照医生指导进行用药治疗。
总之，当结膜炎用药后感觉更严重时，需要仔细分析原因，必要时采取相应的措施来改善。