子宫内膜异位症主要的表现有多种。其中，痛经是比较常见的症状，约25%-35%的患者会出现继发性痛经，且多随局部病变加重而逐年加剧，疼痛多位于下腹部及腰骶部，可放射至阴道、会阴、肛门或大腿等部位，通常在月经来潮前1-2天开始，月经第1天最剧烈，以后逐渐减轻，可持续整个经期。
月经异常表现
经量增多： 部分患者会出现月经量增多的情况，有的女性月经量可能较以往增加1/3左右。这是因为子宫内膜异位症可能会影响子宫的正常收缩，导致子宫内膜面积相对增大等，从而引起经量增多。经期延长： 还有些患者经期会延长，正常经期一般是3-7天，而子宫内膜异位症患者可能会出现经期延长至7-10天甚至更久的情况。
盆腔疼痛表现
性交疼痛： 当子宫内膜异位症累及盆腔腹膜、子宫直肠陷凹等部位时，在性交过程中，由于受到刺激，可能会出现性交疼痛，尤其是在月经前性交时疼痛更明显。盆腔深部疼痛： 除了上述疼痛外，还可能出现盆腔深部的疼痛，比如在排便、排尿时也可能会有疼痛感觉，特别是当子宫内膜异位症累及直肠、膀胱等部位时，这种情况更为常见。
不孕表现
子宫内膜异位症也是导致女性不孕的重要原因之一，据统计，约30%-50%的子宫内膜异位症患者会合并不孕。这是因为异位的内膜组织会影响卵巢的排卵功能、输卵管的拾卵和蠕动功能等，从而影响受孕。例如，异位的内膜可能会导致盆腔粘连，使输卵管周围粘连，影响卵子与精子的结合以及受精卵的运输等。