肾结石疾病的临床症状主要有疼痛、血尿等。一般来说，约40% - 75%的肾结石患者会出现腰痛或腹部疼痛，这种疼痛可表现为突然发作的剧烈绞痛，疼痛常放射至下腹部、腹股沟或股内侧，女性则放射至阴唇。
疼痛表现：
肾区隐痛或钝痛： 部分患者会感到肾区有隐痛或钝痛，这通常是由于较大的结石在肾盂或肾盏内移动不大引起的，疼痛可持续数小时。肾绞痛： 当结石较小，在肾盂或输尿管内移动时，会引起突然发作的肾绞痛，这种疼痛非常剧烈，如刀割样，患者往往难以忍受，还可能伴有恶心、呕吐等症状，疼痛可在短时间内自行缓解或通过药物缓解，但容易反复发作。
血尿情况：
肉眼血尿： 部分肾结石患者会出现肉眼可见的血尿，尿液颜色呈洗肉水样或鲜红色。这是因为结石移动时损伤了肾盂、输尿管的黏膜，导致血管破裂出血。不过，并不是所有肾结石患者都会出现肉眼血尿，有些患者可能只有镜下血尿，需要通过尿常规检查才能发现。镜下血尿： 在显微镜下可以看到尿液中有红细胞，这也是肾结石常见的症状之一，尤其是在结石活动后更容易出现镜下血尿。
其他伴随症状：
尿路感染症状： 如果肾结石合并尿路感染，患者可能会出现尿频、尿急、尿痛等症状，严重时还可能伴有发热、寒战等全身感染症状。这是因为结石阻碍了尿液的排出，使细菌容易在泌尿系统内滋生繁殖。排尿异常： 结石如果堵塞输尿管，可能会影响尿液的正常排出，导致患者出现排尿困难、尿量减少等情况。如果双侧输尿管都被堵塞，还可能引起无尿。