肺纤支镜检查的痛苦程度因人而异，一般来说大部分患者能耐受，检查过程中可能有轻度不适。
检查时的感受差异
个体差异影响： 成年人与儿童的感受不同，成年人相对更能耐受一些操作带来的感觉，而儿童因为身体机能和心理因素，可能会感觉更明显的不适。一般成年人在检查时，多数人会感觉有轻微的咽部不适、胸闷等感觉，但大多都在可接受范围内。检查操作中的感受： 在插入纤支镜时，部分患者会出现咳嗽、咽部异物感等情况，通常持续时间较短，一般几分钟内就能完成检查。对于一些配合较好的患者，这种不适感觉会相对较轻。
检查前的准备减轻不适
禁食禁水要求： 检查前6小时需禁食禁水，这样可以防止检查时发生呕吐误吸。比如成人检查前6 - 8小时就不要进食固体食物，检查前2小时不要喝水，儿童的禁食禁水时间可能根据年龄适当调整，一般2岁以上儿童检查前4小时禁食，2小时禁水。麻醉方式及作用： 检查前会进行局部麻醉，常用的是利多卡因喷雾等方式。局部麻醉可以减轻咽部的敏感程度，从而减少检查时的不适。通过麻醉，能让咽部的感觉神经被阻滞，在插入纤支镜时，患者的咽部不适会明显减轻。
检查后的恢复情况
检查后短时间的不适： 检查后可能会有咽部疼痛、少量痰中带血等情况，一般1 - 2天就能恢复。咽部疼痛通常比较轻微，多数人休息1 - 2天后就会缓解；痰中带血一般量很少，不用过于担心，注意休息，避免剧烈咳嗽即可。特殊人群的注意事项： 对于老年患者或者有基础疾病的患者，检查后的观察时间可能需要适当延长。比如有慢性阻塞性肺疾病的患者，检查后要密切关注呼吸情况，因为检查可能会对呼吸功能有一定影响，需要确保呼吸平稳后再离开医院。