脸上有黑痣可通过以下几种方法在医生指导下祛除：
一、激光治疗：对于直径不足0.5厘米的表浅黑痣，或是形状规则、深度不深的皮内痣，可能会考虑使用激光来祛除。激光治疗主要利用激光的能量来破坏黑痣组织。这种方法相对较为精准，对周围正常组织的损伤较小，但对于较大或较深的黑痣可能效果不佳。
二、化学烧灼：类似于激光祛痣，适用于较小且深度不深的黑痣。如果黑痣直径较大或较深，采用化学烧灼法容易导致脸部留下瘢痕。化学烧灼是通过化学药物来腐蚀黑痣组织。
三、手术切除：当黑痣较大、深度较深，或者黑痣的边缘不规则，又或者黑痣的表面出现溃疡、破溃等异常表现时，多会考虑应用手术切除。这是因为部分黑痣有恶变的潜能或已经发生恶变，此时就不宜再使用激光、冷冻或化学方法来祛除了，这些方法可能会刺激细胞发生恶变或造成恶性黑色素细胞的转移。手术切除能较为彻底地去除黑痣，同时还可以进行病理检查以明确黑痣的性质。
总之，脸上有黑痣切勿自行处理，应前往正规医院的皮肤科就诊，在医生的指导下选择规范的祛除方法，以免留下疤痕或引发其他不良后果。