肛瘘的主要检查方式包含肛门视诊、肛门指诊、肛门镜检查、造影检查、彩超及直肠彩超检查、核磁共振检查。
一、肛门视诊：可直接观察到是否有肛瘘外口结构或因疾病而出现的局部分泌物流出等症状。
二、肛门指诊：能初步判断是否存在质硬的管隙样瘘管结构，同时还可对痔疮、肛裂等其他疾病进行鉴别诊断。
三、肛门镜检查：与肛门视诊相比，能更清晰地查看肛瘘的具体位置和局部结构等。
四、造影检查：将造影剂从外口注入，观察造影剂能否从内口出来，从而确诊肛瘘并大致了解瘘管结构。
五、彩超及直肠彩超检查：对于病变部位表浅的肛瘘，可选择体表彩超来了解组织下的瘘管结构，而若病变部位较深，则可考虑进行直肠B超检查，即将特殊探头置入肛门口进入直肠后，进行B超直视下的观察。
六、核磁共振检查：一般较少运用，其能知晓周围组织、血管的病变情况。
总之，这些检查方式各有特点，可根据具体情况选择合适的方法来准确诊断肛瘘。