二价HPV疫苗主要预防由高危型人乳头瘤病毒（HPV）16型和18型引起的相关疾病。这两种高危型HPV可引发约70%的宫颈癌以及部分宫颈上皮内瘤变（CIN2/3）等疾病。
预防宫颈癌相关病变
16型HPV引发的病变： 高危型HPV16型是导致宫颈癌的主要亚型之一，它会持续感染宫颈上皮细胞，引起细胞的异常增殖，进而可能发展为宫颈癌前病变甚至宫颈癌。据统计，全球范围内由HPV16型感染引发的宫颈癌病例占比较高。18型HPV引发的病变： 高危型HPV18型也与宫颈癌的发生密切相关，同样会导致宫颈上皮细胞的病变，促使宫颈癌前病变以及宫颈癌的发生发展，其引发宫颈癌的风险也不容小觑。
预防外阴癌相关病变
16型HPV对外阴的影响： HPV16型除了引发宫颈病变外，还可能感染外阴部位的皮肤和黏膜细胞，导致外阴上皮内瘤变等病变，若不及时干预，也有发展为外阴癌的潜在风险。18型HPV对外阴的影响： 高危型HPV18型也会累及外阴部位，引起外阴上皮的异常改变，增加外阴癌发生的可能性。
预防阴道癌相关病变
16型HPV对阴道的影响： 高危型HPV16型会感染阴道黏膜，导致阴道上皮内瘤变等病变，长期感染可能引发阴道癌。18型HPV对阴道的影响： 高危型HPV18型同样会侵袭阴道黏膜，造成阴道上皮细胞的异常，进而增加阴道癌的发病几率。