食道镜和胃镜的区别主要在于检查部位和侧重点有所不同。
一、食道镜主要是对食管进行检查。通过食道镜能够清晰地观测食管黏膜的情况，比如是否存在黏膜损伤、糜烂、溃疡、息肉等病变，而且还可以开展相关治疗。当前常用的食道镜是纤维镜。
二、胃镜除了能检查胃和十二指肠外，也可以检查食管。现今常用胃镜来对食管、胃和十二指肠等消化道进行检查。单纯使用食道镜的情形越来越少。胃镜常用电子胃镜，它既能观察食管，又能观察胃和十二指肠。
所以，如果患者出现消化道症状，特别是食管症状，既可以选择食道镜，也可以选择胃镜。但要是患者的症状在上腹部，无法确切判断是食管疾病还是胃疾病，此时选择胃镜会更为合适，因为它既能观察食管又能观察胃和十二指肠，同时还能实施内镜下治疗。
总之，食道镜和胃镜在检查部位和功能上存在差异，应根据患者具体症状和需求来选择合适的检查手段。