宝宝头顶有个凹陷通常是囟门，这是由于两侧颅骨还没有完全闭合的一种表现，多数情况下是正常的，属于生理性因素，但也有一些是病理因素导致的，如喂养不当、体内水分缺失、脑发育不良等。
一、生理性原因
后囟门一般在出生后3个月闭合，前囟门要到1岁半才闭合。如果宝宝还小于3个月，那么通常是生理性的囟门未闭合，无需过度担心。
二、病理性原因
1.喂养不当
喂养不当会使宝宝出现重度营养不良，身体消瘦，进而导致囟门凹陷。此时需要加强营养，给宝宝增加维生素D、钙等营养物质的补充。
(1)要确保宝宝摄入足够的奶量或其他适宜的食物。
(2)可根据医生建议补充相应的营养补充剂。
2.体内水分缺失
颅内的脑脊液和身体的血液、组织液会不断交换以保持平衡。当体内水分缺失时，脑室的脑脊液会减少，压力降低，从而使囟门出现明显凹陷。如果宝宝同时有腹泻、呕吐等其他症状，那就表明身体已经处于脱水状态，需要及时补充水分来缓解宝宝的症状。
(1)可以通过口服补液盐等方式补充水分和电解质。
(2)严重时可能需要通过静脉输液来纠正脱水。
3.脑部发育不良
有些宝宝由于在胚胎期宝妈发生感染或患有疾病，导致脑部发育不良，头颅较小。出生时头围小，出生后5-6个月囟门即提前闭合，造成小头畸形，从而引起囟门凹陷。甲状腺机能低下所致的呆小症患儿，囟门也会迟迟不闭，进而出现囟门凹陷的情况。
(1)对于脑部发育不良的情况，需要尽早进行诊断和治疗干预。
(2)针对甲状腺机能低下等疾病，要及时给予相应的治疗。
总之，宝宝囟门凹陷需要仔细甄别原因，生理性的通常无需特殊处理，而病理性的则要根据具体情况采取相应的措施进行纠正和治疗。