宫外孕主要是由于输卵管因素、宫腔操作史以及受精卵游走等原因导致的。据统计，约90%以上的宫外孕发生在输卵管部位。
输卵管因素
输卵管炎症：这是引发宫外孕最常见的原因。比如淋球菌、沙眼衣原体等引起的输卵管炎，会使输卵管黏膜粘连、管腔变窄，影响受精卵的正常运行，导致受精卵在输卵管内着床。输卵管炎症分为急性和慢性，慢性输卵管炎长期存在，更易增加宫外孕风险。输卵管手术史：曾做过输卵管相关手术的人，宫外孕几率会升高。例如做过输卵管绝育术又再通的，输卵管的结构和功能受到影响，受精卵通过时就容易受阻，从而在输卵管着床。像接受过输卵管再通术的女性，宫外孕发生率比常人高10% - 20%。
宫腔操作史
人工流产：频繁人工流产会增加宫外孕风险。因为人工流产可能引起子宫内膜损伤、炎症等，影响受精卵着床位置。有过1次人工流产史的女性，宫外孕发生率比无人工流产史者高1倍；有2次及以上人工流产史的，风险会更高。宫腔手术：如宫腔镜下手术等宫腔操作，可能导致宫腔粘连或输卵管通畅度改变，使得受精卵难以正常到达宫腔，进而在宫外着床。
受精卵游走
受精卵运行速度异常：正常情况下受精卵会按时到达宫腔着床，但如果受精卵游走速度过慢，就可能在到达宫腔前就在输卵管着床。比如一侧卵巢排卵，受精卵经过宫腔后向对侧输卵管运行，由于运行时间过长，在对侧输卵管着床形成宫外孕。输卵管蠕动异常：输卵管的正常蠕动对受精卵运输至关重要，若输卵管蠕动功能出现异常，比如蠕动过强或过弱，都可能干扰受精卵的正常运输，导致受精卵在输卵管着床。