扁平疣的最佳治疗方法需要根据患者的具体情况来选择，以下是一些常见的治疗方法：
1.外用药物治疗：外用药物治疗扁平疣是一种常用的方法。常用的外用药物包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等。这些药物可以促进扁平疣的消退，但需要坚持使用一段时间才能见到效果。
2.物理治疗：物理治疗也是治疗扁平疣的常用方法之一。常用的物理治疗方法包括冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗等。这些方法可以直接破坏扁平疣的疣体，使其脱落。
3.口服药物治疗：对于疣体较多或病情较严重的患者，口服药物治疗可能是一种更好的选择。常用的口服药物包括抗病毒药物、免疫调节剂等。这些药物可以调节患者的免疫系统，促进扁平疣的消退。
4.中医治疗：中医治疗扁平疣也有一定的效果。常用的中医治疗方法包括中药外洗、中药内服、针灸等。这些方法可以从整体上调节患者的身体状况，促进扁平疣的消退。
需要注意的是，扁平疣具有传染性，患者应避免搔抓疣体，以免疣体扩散。同时，患者应注意个人卫生，保持皮肤清洁，避免与他人共用毛巾、浴巾等物品。