卵巢囊肿术后疼痛，有正常现象，也可能是手术切口感染以及术后粘连等原因导致，具体如下：
一、正常现象：手术切口会刺激皮肤肌肉的疼痛感受器，接着疼痛刺激沿神经元传导至神经中枢，促使神经中枢释放P物质和神经递质，P物质是一种疼痛神经递质，会让神经元感觉到疼痛。一般来说，术后出现疼痛属于正常生理现象。切口组织大概在2至3周开始增生形成疤痕，由于疤痕处有新生的神经末梢，所以疤痕会出现痒痛，其中以刺痛最为明显，通常无需特殊处理，会随着伤口愈合而自行缓解。若疼痛较为剧烈，可在医师指导下使用洛索洛芬钠片、塞来昔布胶囊、醋氯芬酸片等药物。
二、手术切口感染：当手术切口发生感染时，同样会刺激神经产生疼痛，多同时伴有红、肿、热以及切口分泌物增多的情况。此时需要加强切口的消毒和换药工作，必要时进行引流，同时在医生指导下使用注射用头孢美唑钠、注射用头孢曲松钠、注射用哌拉西林钠等进行抗感染治疗，并且可加强营养，采取高蛋白饮食来促进伤口愈合。
三、术后粘连：指手术造成的组织器官损伤修复过程中形成的异常纤维连接，这与缺血、异物刺激或感染等炎症反应相关。在某些情况下，腹部手术后腹腔粘连会引发严重并发症，包括但不限于粘连性肠梗阻、二次腹部手术难度增加、慢性腹痛以及女性不孕等，需要根据临床症状、检查结果等进行综合评估，以确定是否需要手术治疗。
总结概况提示：卵巢囊肿术后疼痛的原因多样，要明确具体原因并采取相应的处理措施。正常疼痛可观察等待其自行缓解，感染引起的疼痛要加强抗感染治疗和伤口处理，术后粘连则需根据具体情况评估是否手术。