牙龈瘘管多是由牙齿相关疾病引起的，比如大约60%的牙龈瘘管是因为根尖周炎导致的。
一、根尖周炎引发
龋齿未及时治疗：当牙齿发生龋齿后，如果龋洞没有得到及时填充，细菌会继续向深处感染，累及牙髓，进而引发根尖周炎。比如一颗牙齿长时间有龋洞，患者没有重视，细菌就会从龋洞进入牙髓腔，引起牙髓炎症，炎症进一步扩散到根尖周组织，就可能形成牙龈瘘管。牙髓坏死继发：牙髓坏死通常是由于严重的外伤、长期的慢性炎症等原因导致牙髓组织死亡。牙髓坏死后，感染物质会通过根尖孔扩散到根尖周围的组织，引发根尖周炎症，最终形成牙龈瘘管。例如，有过牙齿外伤史的患者，牙齿受伤后牙髓可能逐渐坏死，之后就有可能出现牙龈瘘管。
二、牙周炎相关
菌斑牙石堆积：口腔中如果长期不注意清洁，菌斑和牙石会不断堆积在牙齿表面和牙龈边缘。菌斑中的细菌会产生有害物质，刺激牙龈组织，引发牙周炎。随着牙周炎的发展，炎症会向深部组织蔓延，波及到牙周膜、牙槽骨等，进而可能形成牙龈瘘管。一般来说，每天刷牙不到2次、不使用牙线清洁的人，更容易出现菌斑牙石堆积，引发牙周炎相关的牙龈瘘管。牙周袋形成：牙周炎发展到一定程度会形成牙周袋，牙周袋内会有大量的细菌、炎症渗出物等。这些物质长期刺激牙龈和周围组织，导致炎症持续存在并向深部扩散，最终形成牙龈瘘管。比如牙周炎患者的牙周袋深度如果超过4毫米，就比较容易出现牙龈瘘管相关的问题。
三、智齿冠周炎波及
智齿萌出受阻：智齿萌出过程中，常常会出现萌出受阻的情况，比如部分萌出或者完全埋伏阻生。萌出受阻的智齿周围会形成一个盲袋，盲袋内容易积存食物残渣和细菌，从而引发智齿冠周炎。当智齿冠周炎的炎症扩散时，就可能累及周围的牙龈组织，形成牙龈瘘管。尤其是垂直阻生或者近中阻生的智齿，更容易导致这种情况发生。冠周炎反复发作：如果智齿冠周炎没有得到及时有效的治疗，就会反复发作。长期的炎症刺激会使牙龈组织反复受到损伤，炎症不断向周围扩散，进而形成牙龈瘘管。有些患者智齿冠周炎可能反复发作数年，最终导致牙龈瘘管的形成。