患肾结石半夜疼是因为尿液浓缩、体位改变、神经反射、活动减少以及水分摄入减少等因素。具体如下：
一、尿液浓缩：在夜间睡眠时，人体新陈代谢相对缓慢，肾脏产生的尿液量会减少，导致尿液在肾脏中停留的时间较长。这样一来，尿液中的盐类和晶体物质就更容易浓缩沉淀，进而增加结石与尿道壁之间的摩擦，从而引发疼痛感。
1.（1）尿液中的盐类和晶体物质在浓缩状态下更容易积聚形成结石。
（2）浓缩的尿液会加大结石与尿道壁的接触面积和摩擦力。
二、体位改变：当处于卧位时，肾脏内的尿液滞留情况会更为明显。同时，结石与尿道之间的通路可能会因体位变化而变窄或受到不同程度的压迫，这就容易导致疼痛加剧。
1.（1）卧位会使尿液在肾脏中潴留更显著。
（2）体位改变可影响结石与尿道的相对位置和通畅程度。
三、神经反射：在半夜睡眠时，全身肌肉处于相对松弛状态，尿液的流动速度也会减慢。这种情况下，可能会刺激到尿道和肾脏周围的神经末梢，从而引起疼痛反应。
1.（1）睡眠时肌肉松弛会影响尿液流动。
（2）神经末梢受到刺激可引发疼痛。
四、活动减少：半夜时身体处于静止状态，肾脏和尿道的活跃度降低，结石在尿道中的位置相对固定，这会使得疼痛感更为明显。
1.（1）静止状态下肾脏和尿道活动减弱。
（2）结石位置相对稳定而使疼痛感受更突出。
五、水分摄入减少：晚上睡眠期间，很多人会不自觉地减少饮水量，这会导致尿液浓缩度进一步增加，结石与尿道壁的接触面积增大，从而刺激尿道黏膜，引发疼痛。
1.（1）夜间饮水减少会加重尿液浓缩。
（2）浓缩尿液刺激尿道黏膜产生疼痛。
需要注意的是，并非所有肾结石患者都会在半夜出现疼痛，个体之间存在较大差异。而且疼痛的程度和持续时间也各不相同，有些人可能只是轻微不适，而有些人则可能会经历剧烈疼痛。如果出现肾结石疼痛，应及时就医进行诊断和治疗。
总结：患肾结石半夜疼的原因包括尿液浓缩、体位改变、神经反射、活动减少和水分摄入减少等，个体在表现上有差异，疼痛程度和持续时间不同，一旦疼痛发作应尽快就医。