精囊炎多由病原体感染引起，常见的致病菌有大肠杆菌、克雷白氏产气杆菌、变形杆菌及假单胞菌等。当尿道受到感染，细菌可经射精管上行蔓延至精囊，引发精囊炎；另外，前列腺、直肠、膀胱等部位的感染，也可能波及精囊，导致发病。
病原体感染途径
经尿道逆行感染：这是最常见的途径。比如，不注意个人卫生，尿道中的细菌容易通过射精管进入精囊。例如，有不洁性生活史的人，感染病原体后就可能经尿道逆行感染精囊引发精囊炎。血行感染：身体其他部位的感染病灶里的病原体，可通过血液循环到达精囊。像皮肤、扁桃体、牙齿等部位感染后，病原体随血液流动，到达精囊，从而引起精囊炎。
邻近器官炎症蔓延
前列腺炎蔓延：前列腺与精囊关系密切，前列腺发生炎症时，炎症可能直接蔓延至精囊，引发精囊炎。比如，慢性前列腺炎患者，如果炎症没有得到有效控制，就比较容易并发精囊炎。直肠炎症蔓延：直肠距离精囊较近，直肠发生炎症时，病原体可能通过直接蔓延的方式侵犯精囊。例如，患有直肠炎的患者，若炎症持续存在，就有累及精囊导致精囊炎的风险。
其他因素影响
性生活不规律：过度纵欲、频繁手淫或者禁欲时间过长等，都可能导致精囊反复充血，局部抵抗力下降，容易诱发精囊炎。比如，一些年轻男性性生活不节制，就可能增加患精囊炎的几率。盆腔手术损伤：经尿道前列腺电切术等盆腔手术，可能会损伤精囊部位，使精囊防御能力降低，从而引发感染导致精囊炎。