男性小便时小腹部疼痛，往往与急性膀胱炎、肾结石或尿道肿瘤等有关。
一、急性膀胱炎：男性患上急性膀胱炎，可能与喝水少、经常憋尿以及清洁不佳等因素相关。此时患者通常还会伴有尿急、尿频等症状表现。建议及时前往医院，完善尿常规、尿培养等相关实验室检查，以明确病情，然后积极采用抗感染药物进行治疗。若尿培养结果显示为结核杆菌，就需要服用抗结核药物，如异烟肼、利福平等。
二、肾结石：这与个人饮食习惯、肾脏排泄功能异常、代谢异常等有关。疼痛可放射至腰部及会阴部，从而出现小便时小腹痛的情况。建议进行腹部平片或腹部CT检查，这样能够初步判断结石的大小及位置。如果结石直径较小，可以通过增加饮水量等方式来处理；若直径较大，可根据结石的位置选择输尿管镜取石、经皮肾镜取石或体外冲击波碎石等治疗方法。
三、晚期尿道肿瘤：如膀胱癌，患者会有尿急、尿痛等正常，而当发生转移时可出现小腹痛现象。可到泌尿外科就诊，进行膀胱镜检查，并在镜下取活组织做病理检查，如果分期较晚患者已无手术时机，可进行膀胱灌注化疗或盆腔放疗等处理。
总之，当男性出现小便时小腹部疼痛时，应及时就医，通过相关检查明确具体病因，并采取针对性的治疗措施。